Nghiên cứu hệ gen có chức năng trong chiến lược chọn tạo giống mía: những thách thức và chiến lược chính

 Nghiên cứu hệ gen có chức năng trong chiến lược chọn tạo giống mía: những thách thức và chiến lược chính

Nguồn: Rubab Shabbir, Talha Javed, Sheng-Ren Sun, Zhu-Qing Wang, Wei Zhang, San-Ji Gao, Qin-Nan Wang. 2026. Functional genomics in sugarcane breeding: key challenges and strategies. Crit Rev Biotechnol.; 2026 May; 46(3):419-439. doi: 10.1080/07388551.2026.2614075.

Mía đường, là loài cây trồng chủ lực cung cấp nguồn đường và năng lượng sinh học trên toàn thế giới tại giao lộ của sự phức tạp vô cùng về hệ gen (genome complexity) và sự đổi mới nông nghiệp, mang đến tiềm năng khổng lồ góp phần vào tương lai bền vững. Genome học chức năng (functional genomics) với tính chất phân định chính xác của nó và quy trình tháo tác các gen đích  có thể giúp nhà nghiên cứu mở khóa tiềm năng ấy và thúc đẩy được mội nỗ lức trong cải tiến giống mía. Tuy nhiên, hệ gen của loài đa bội thể của cây mía đường với: dị hợp tử caoy, phân tử DNA lập đoạn cao, tính chất đa bản sao của gen đồng dạng, tương tác epistatis (tương tác không alen phức tạp), etc., cho nên, thách thức lớn trong xác định chú thích gen, giải trình tự hệ gen, chỉnh sửa hệ gen, và định tính kiểu hình. Chu kỳ lai tạo giống quá dài, hiệu suất chuyển hóa thấp, tiêu tốn nhiều thời gian, và các phương pháp chuyển đổi tốn nhiều công sức, làm phức tạp thêm quá trình chỉnh sửa hệ gen. Những tiến bộ gần đây của “functional genomics” đang chuyển hóa theo kịch bản này, như công bố hệ gen tham chiếu đầy đủ của "R570," đã và đang cung cấp một cái nhìn sâu sắc về cấu trúc và chức năng của hệ gen cây mía.
 

Phương pháp GWAS / sàng lọc di truyền (GS) làm tăng cường việc lập bản đồ di truyền tính trạng mục tiêu và dự đoán được giá trị cải tiến giống nằm thúc đẩy chu kỳ chọn giống nhanh hơn.

Kỷ nguyên hiện nay là “smart breeding” (chọn giống khôn ngoan) với tích hợp của tin sinh học với  công cụ chỉnh sửa gen tiến bộ, i.e., hệ thống CRISPR/Cas (Cas-proteins, Cas-RNPs, d-Cas-RNPs, và CRISPRa/i), và phương pháp đánh giá kiểu hình hiệu quả cao là cách tiếp cận có ý nghĩa để khắc phục được nút thắt chuyển đổi (transformation bottlenecks), khai thác những tính trạng có kiến trúc phức tạp và giải quyết được thách thức của đa bội thể. Do vậy, bài tổng quan này tóm lược  lại những thách thức chính và tập trung vào những tiến bộ gần đây, gợi ý những chiến lược tối ưu phục vụ cải tiến giống mía tương lai trên cơ sở “functional genomics”.

Xem https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41592905/

Comments

Popular posts from this blog

RNAi và chỉnh sửa hệ gen cây mía đường: Tiến bộ và Triển vọng

Phân tích theo hình thức so sánh hệ thống transcriptome để xem xét chức năng của SoCER4 trong tổng hợp alkanol của mía đường

GWAS tìm hiểu họ gen SUT của mía đường chỉ ra rằng ShSUT4 là một regulator chủ chốt trong phản ứng của cây mía đối với stress phi sinh học